arbeitet seit seinem 1983 abgebrochenen Studium an der Filmhochschule der DDR freiberuflich als Autor und Regisseur für Film, Theater und Funk. Seine Dokumentarfilme und dokumentarischen Rundfunkarbeiten in der DDR wurden gesperrt und gelangten erst nach 1990 an die Öffentlichkeit. Der Titel seines ersten Kurzdokumentarfilms Wozu denn über diese Leute einen Film ist zu einem Leitgedanken seiner Arbeitsweise geworden. Seine Filme zeigen Menschen, deren Leben sich als Bild historischer Geschehnisse und Entwicklungen zeigt, im heutigen Deutschland, aber auch in Lateinamerika. Von 1990 bis 1997 inszenierte Heise am Berliner Ensemble, anschließend am Theater 89 in Berlin und am Theater Heilbronn. Von 2007 bis 2013 war er Professor für Film an der Hochschule für Gestaltung Karlsruhe, von 2013 bis 2022 Professor für Kunst und Film an der Akademie der bildenden Künste Wien. Er ist seit Mai 2018 Direktor der Sektion Film und Medienkunst an der Akademie der Künste in Berlin.